目斗嶼由於島狹地窄，為避免因風浪的長期侵襲，使塔身銹蝕，所以燈塔在設計之初，

即選擇不易銹蝕的鑄鐵做為塔身材料，又因附近海域多霧，澎湖旅行社推薦

將圓形的燈塔外觀漆成黑白相間的平行條紋，做為醒目的警告標誌，較易引起航行船隻注意。

由玄武岩組成的目斗嶼，極具原始風貌，黑色的岩石讓島的四周立體感十足且層次分明，激起浪花朵朵，
 
透出一份豪壯之氣。從吉貝嶼前往目斗嶼的航程上，由於水域較淺，充足的陽光讓此海域擁有多樣化的海洋生物，
 
目斗嶼燈塔的塔高39.9公尺，為台灣地區與遠東地區最高的銑鐵鑄造燈塔(居住者為燈塔看守管理員)。

其取水口設在燈塔內部，將燈塔及宿舍屋頂蓄積的雨水源直接引進塔內，澎湖套裝行程 

是台灣地區唯一將蓄水池取水口設在塔內的燈塔。目前島上無電，電力全靠三部發電機自行發電，提供燈塔運轉。